Génszekvenáló műszer digitális kompenzálása
![]() professor
Szoba: IE437
Tel.:
+36 1 463-2065 Email: daboczi (*) mit * bme * hu |
A kiírás adatai
A genetikai kód meghatározására (gén szekvenálás) többféle eljárás, illetve műszer létezik. Ezek közül az egyik az ún. nanopórus, melynek lényege, hogy egy membrán parányi pórusán (nanopórus) áthaladó DNS szál a póruson való áthaladás közben megfigyelehető, azonosítható. Ehhez a membrán két részét megfelelő feszültség alá helyezik, majd mérik az áramot. A DNS szál áthaladásakor ez az áram a genetikai kódnak megfelelő áramugrások formájában jelentkezik. Mivel nagyon kis áramok méréséről van szó, igen nagy a zajszint, ezért analóg aluláteresztő szűrőt alkalmaznak a mintavételezés előtt. Ez a szűrés azonban torzítja a hasznos jelet, így az állapotváltozások ideje nem detektálható kellő pontossággal.
Feladatok:
- mérési környezet módosítása a felbontás javítása érdekében
- inverz szűrési módszerek (jelek digitális utófeldolgozása) adaptálása a szűrő torzításának kompenzálására
Szükséges ismereket:
- digitális jelfeldolgozás
Együttműködő partner:
- University of California, Santa Cruz, USA
A témára MSc hallgatót várok. Angol nyelvtudás szükséges